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    首個生物醫療開放大數據研究中心在滬成立

    時間:2016-11-24 14:56:23 點擊次數:

    今天,由華東理工大學信息學院、梅斯醫學主辦,主題為“開放·鏈接·服務”的2016生物醫療大數據研討會暨華理-梅斯生物醫藥開放鏈接大數據研究中心成立儀式在華東理工大學舉行,來自復旦大學、交通大學-耶魯大學聯合生物統計中心、中科院系統生物學重點實驗室、曙光醫院、萬達信息等高校、科研機構、醫療機構和企業的300余位專家學者與會,圍繞大數據開放與共享、數據關聯,大數據關鍵技術與大數據在生物醫藥行業應用等話題展開研討。

    同時,研究中心還向參會代表贈送了基于RDF(Resource Definition Framework)格式,關聯基因、藥品與疾病的約1個G的開放鏈接數據(Linked Open Data)集合?;ヂ摼W+時代,大數據被認為是改變行業的關鍵節點,生物醫療行業亦不例外。

    據華東理工大學阮彤老師介紹,近年來,生物醫療行業的海量數據迅速形成,但相對于國外大量開放鏈接數據集對生物醫藥領域研究的促進發展,國內的生物醫療行業數據封閉、分散且表示方式不一致,制約了整個行業的發展。為此,華東理工大學信息學院攜手上海梅斯醫學,在上海市經濟與信息化委員會指導以及上海市大數據聯盟的大力支持下,成立了“生物醫藥開放鏈接大數據聯合研究中心”,旨在充分發揮雙方優勢,提供開放的中文基礎生物醫藥數據,關聯國內外已有的生物醫藥開放鏈接數據,搭建生物醫療大數據研究公共服務平臺,為生物醫藥大數據挖掘工作提供更多的支撐和服務。

    “醫療大數據與精準醫療的聯姻,為實現健康醫療的精準預防、精準**、精準預后等提供了可行之路?!比A東理工大學劉昌勝副校長表示,近年來,生物醫療行業的海量數據迅速形成,同時,伴隨著大數據處理關鍵技術的突破、數據開放等契機的發展,大數據將在促進行業發展中發揮重要作用。梅斯醫學董事長張發寶認為,當前衛生信息化建設的發展很快,與醫藥相關的行業數據正在以前所未有的速度增長,大數據應用也已起步,開放醫藥大數據的研究已成為熱點,一些國際著名大學著手成立大數據研究機構,但是,在數據利用、技術應用等多方面仍然面臨諸多亟需解決的問題。據介紹,生物醫藥大數據挖掘是生物醫藥與信息技術的交叉學科。

    在大數據挖掘方面,華東理工大學擁有計算機科學、數學以及統計學等學科優勢,學生團隊曾榮獲2014年百度知識圖譜數據分析競賽一等獎,2015百度大數據競賽一等獎及特別貢獻獎,并且在西班牙舉辦的2015年語言學鏈接開放數據競賽中奪魁。目前華東理工大學正與曙光醫院、萬達信息、上海申康合作,共同承擔國家863項目“心血管疾病與腫瘤疾病中西醫臨床大數據處理分析與應用研究”。華東理工大學在生物醫藥的相關研究領域工作中也取得了一系列成果,在**化學領域**期刊——美國《**化學》雜志上發表的研究論文數量也領先于國內其他高等院校。按論文發表數量衡量,在國際Top10研究機構中,在“基于結構的**設計”領域中與美國普渡大學并列第三。上海梅斯醫藥科技有限公司作為國內**的醫藥生物和醫療健康產業服務平臺,提供專業醫藥生物信息服務、臨床醫學研究協助服務、臨床研究成果轉化服務等。特別是在醫學領域具有核心的資源,在臨床醫學領域具有強大的學術團隊。

    據悉,華理-梅斯生物醫藥大數據研究中心,將從開放鏈接大數據和專注多元化開發模式等方面為進一步推動生物醫藥大數據的發展開展相關研究。通過開放鏈接大數據 實現“開放?鏈接?服務”?;诨A知識圖譜、提供數據下載、瀏覽、查詢、問答、語義標注等技術服務,并在此基礎上,提供電子病歷數據質量檢測、疾病分類、藥品成分查詢等業務服務。為社會公眾提供健康指導,為醫療與醫藥企業提供專業信息服務。在未來三年內能為政府公共衛生系統提供輔助決策咨詢服務,為醫院、醫藥企業提供疾病知識庫、藥品知識庫等的查詢服務、輔助**服務。通過共享、反饋,促進知識庫的更新和發展,依托于上海大數據產業創新聯盟與中關村大數據聯盟,聯合各類醫療機構與IT機構,形成生物醫藥開放大數據社區,進而逐步實現“開放?鏈接?服務”的服務理念。專注多元化開發模式加速生物醫藥大數據創新。利用異構數據抽取、整合、處理技術,知識圖譜技術,語義標注技術,醫藥大數據挖掘技術的研究及算法并行化改造技術,語義質量控制技術等生物醫藥領域的關鍵技術展開研究。通過創新基地建設,有效解決現有系統封閉、資源分散等問題,大幅提升成果快速轉化擴散能力。



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